Родился 28 декабря 1901 года в деревне Нижняя Сафроновка ныне Новоодесского района Николаевской области.
В сентябре 1922 года был призван в ряды Красной Армии и направлен красноармейцем в 3-й стрелковый полк в составе Отдельной Кавказской Краснознамённой армии (Кутаиси). Позже – принимал участие в советско-финской войне.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 21 марта 1940 года «за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с финской белогвардейщиной и проявленные при этом отвагу и геройство» капитану Анатолию Иосифовичу Петраковскому присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда».
В середине августа 1941 года полковник Петраковский направлен в Харьковский военный округ, где был назначен на должность командира 395-й стрелковой дивизии, которая принимала участие в боевых действиях под Мариуполем в ходе Донбасской оборонительной операции, а затем – в Ростовских оборонительной и наступательной и Воронежско-Ворошиловградской оборонительной операции. В феврале 1943 года назначен на должность заместителя командующего 18-й армии, которая принимала участие в боевых действиях в ходе Краснодарской наступательной операции и освобождении Краснодара.
16 июля 1943 года назначен на должность командира 317-й стрелковой дивизии, ведшей боевые действия на Таманском полуострове, но уже 9 июля его по болезни эвакуировали в госпиталь в Москву. 18 августа того же года назначен на должность командира 57-го стрелкового корпуса 37-й армии Степного фронта, который принимал участие в боевых действиях в ходе битвы за Днепр, а также в Нижнеднепровской наступательной операции.
После окончания войны был направлен в Военную академию имени М. В. Фрунзе, где служил на должностях начальника курса и начальника учебного отделения Курсов усовершенствования командиров стрелковых дивизий при этой академии.
В апреле 1949 года назначен на должность начальника военного управления штаба Советской военной администрации в Германии, в марте 1950 года – на должность начальника военного отдела Управляющего делами Советской контрольной комиссии в Германии, а в январе 1951 года – на должность начальника Управления боевой и физической подготовки штаба Одесского военного округа. С ноября того же года состоял в распоряжении Главного управления кадров Советской Армии и в мае 1952 года назначен на должность начальника военной кафедры Свердловского юридического института.
Генерал-майор Петраковский в ноябре 1956 года вышел в отставку. Умер 3 сентября 1969 года в Ростове-на-Дону.